发票丢失影响的是「用哪张凭证入账」，不影响这笔业务本身是否真实发生。判断顺序是：先看票种，再看丢的是哪一联，再看这张票是用来记账还是用来抵扣。业务真实、合同和付款记录齐全的前提下，多数情形都有对应的替代凭证路径；真正容易出问题的，是拿一张来源说不清的复印件直接顶上去。
01发票丢失后，先判断三件事：票种、联次、用途
同样是丢发票，专用发票、普通发票、电子发票的处理路径不一样，判断顺序是先看票种，再看丢的是哪一联，再确认这张票的用途是记账、抵扣，还是两者都要。
增值税专用发票丢了，购买方和销售方各自要做什么？
购买方丢失已开具的专用发票，常见做法是由销售方提供该份发票记账联的复印件并加盖发票专用章，作为购买方记账的替代凭证；能不能同时用于进项税额抵扣，取决于丢的是发票联还是抵扣联，以及主管税务机关的具体要求。
如果发票联和抵扣联都丢了，替代凭证的来源只能是销售方留存的记账联，所以要先确认对方还能不能调出这张票的开票记录。如果只丢其中一联，通常可以用未丢失那一联的复印件处理，复印件上的发票代码、号码、开票日期、金额、税额要和开票方系统里的信息逐项核对一致，再往下走流程。
增值税普通发票丢了怎么办？
普通发票丢失的处理相对简单，但同样不能拿一张没有来源说明的复印件直接入账。常见做法是请开票方提供记账联复印件并加盖发票专用章，或者在符合作废、红冲条件的情况下重新开具。
如果开票方已经注销、联系不上，就没有对方的记账联复印件可拿，这时需要用合同或订单、付款流水、收货或验收记录等业务资料组成证据链，并向主管税务机关说明情况。这类情形能不能作为入账凭证，由主管税务机关按实际情况判断，不要自己先下结论。
电子发票还要担心丢失吗？
电子发票以电子文件形式交付，可以重新下载或重新索取，一般不需要按纸质发票丢失的路径处理，但截图和照片不能替代原始文件。
留存时应保存 PDF、OFD 等原始格式文件，并保证文件内容与开票信息一致。打印出来的纸质件只是呈现方式，如果只留打印件、原始文件已经找不到，遇到核对时同样说不清楚。
02复印件能不能入账：按情形对照
复印件能不能入账，答案不是简单的「能」或「不能」，而是看这张复印件从哪来、有没有加盖发票专用章、有没有业务资料配套。下表的前提是业务真实发生、开票方仍存续，具体口径以主管税务机关要求为准。
| 丢失情形 | 常见替代凭证 | 需要谁配合 | 还要注意什么 |
|---|---|---|---|
| 纸质专用发票，发票联和抵扣联都丢 | 开票方记账联复印件，加盖发票专用章 | 开票方 | 记账与抵扣要求可能不同，先问主管税务机关 |
| 纸质专用发票，只丢其中一联 | 未丢失那一联的复印件 | 购买方自行复印，必要时请开票方盖章 | 复印件信息要与开票方留存信息一致 |
| 纸质普通发票丢失 | 开票方记账联复印件并盖章，或符合条件时重新开具 | 开票方 | 重新开具要看是否跨月、是否已申报 |
| 电子发票 | 重新下载的原始电子文件 | 开票方或购买方自行下载 | 截图、照片不作为留存原件 |
| 开票方已注销或失联 | 合同、付款凭证、验收或物流单据等业务资料 | 购买方自行整理 | 能否入账由主管税务机关判断，先咨询再处理 |
03补救按这个顺序走
补救的顺序是先把信息理清楚，再找开票方要替代凭证，然后才处理入账和留存。顺序颠倒，往往白跑一趟还得回头补材料。
动手前要理清哪些信息？
- 记下发票代码、号码、开票日期、金额、税额、开票方名称和纳税人识别号，能从合同、付款记录或对方系统里查到的先查出来。
- 找出这笔业务的合同或订单、付款流水、收货或验收记录，确认业务链条完整。
- 确认这张票有没有已经入过账、有没有已经做过进项认证，避免后面重复处理。
怎么让开票方配合？
- 说明丢失的是哪一联，请对方提供记账联复印件并加盖发票专用章。
- 如果对方不便提供复印件，或者发票还没交付就丢了，协商在符合条件时作废或红冲后重新开具。
- 拿到复印件后先核对信息，与合同、付款金额对得上再入账。
入账和留存要注意什么？
- 复印件与情况说明、业务凭证一起装订归档，不要单独一张纸夹在凭证里。
- 涉及进项抵扣的，先向主管税务机关确认本地的报送或留存要求。
- 同一笔业务只入账一次，复印件是替代凭证，不是第二张凭证。
04这几类做法容易出问题
发票丢失本身不是违规，但补救过程中的几类做法，会把一个小问题变成账、票、申报三边对不上的麻烦。
复印件重复入账会有什么问题？
一张发票对应一笔业务，复印件只是替代原件，不是新增凭证。如果这张票已经认证或入账，再拿复印件走一遍，账面和申报数据就会对不上。发现重复处理，应当主动更正，而不是等比对结果出来再解释。
拿别的发票顶替行不行？
用其他发票充数属于凭证不实，风险远大于丢失本身。另一种常见情况是只留复印件、不留合同和付款记录，一旦被问到业务真实性，很难把整条链说清楚。复印件加业务资料一起留存，才经得起核对。
开票方失联了怎么办？
开票方注销或联系不上，就没有对方的记账联复印件可拿，只能靠业务资料组成证据链，并主动向主管税务机关说明情况。能不能作为入账凭证由主管税务机关判断，不要凭经验自行认定。发票的开具、取得和保管以《中华人民共和国发票管理办法》为依据，遇到具体情形时以该办法和当地办理指南为准。
05拿不准时去哪里核实、平时怎么留证据
各地对联次要求和报送材料的口径不完全一样，比较稳妥的做法是动手之前先问清楚，再准备材料，避免材料交上去又被打回。
打 12366 之前先准备什么？
把发票种类、丢失的是哪一联、发票代码和号码、开票日期、金额税额、是否已认证抵扣、开票方是否还能联系上这几项信息写在手边，再拨 12366 纳税缴费服务热线，客服可以直接给到对应的办理路径，比笼统问「发票丢了怎么办」有效得多。
线上能查到什么？
国家税务总局网站（www.chinatax.gov.cn）可以查政策文件和办税指南，电子税务局可以查发票信息和办理进度。需要确认对方企业是否已注销，可以通过国家企业信用信息公示系统查询，也可以拨 12345 政务服务便民热线咨询办理入口。
平时怎么留证据，避免下次再折腾？
收到发票当天就扫描或拍照归档，电子发票保存原始文件而不是截图；按月份建一个简单台账，记下发票号码、金额和对应业务；每隔一段时间和常往来的开票方对一次账。这些动作花不了多少时间，真丢票的时候能省掉大量来回沟通。