关联交易定价是否会被调整，取决于两件事：交易价格是否偏离独立企业之间的正常水平，以及企业能不能拿出支撑这个价格的资料。前者决定有没有被调整的空间，后者决定被问到时说清说不清。下面按实际处理的顺序讲，先说交易发生时要留什么，再说被问到或被调整时怎么应对。
01先弄清哪些交易属于关联交易，不只看股权比例
关联关系不只看持股比例，还要看资金、经营、购销等方面是否存在直接或间接的控制关系，以及是否同受第三方控制。判断标准写在《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则的关联关系认定部分，属于税务机关判断交易是否纳入特别纳税调整范围的依据。
日常容易被忽略的关联交易有几种：
- 母子公司、兄弟公司之间的货物买卖、服务费、管理费、资金拆借；
- 同一自然人控制下的两家公司互相开票；
- 关联方之间无偿或低价提供场地、设备、人员；
- 关联方代付费用、代为承担成本，账上长期挂往来款。
这些情形不一定马上产生税负，但都属于定价需要能解释的范围。如果业务真实、价格有依据，风险主要在资料是否完整；如果业务本身缺少商业实质，争议通常不只在价格上。
02定价要留证据，判断标准是独立企业之间会怎么定
关联交易定价的核心判断标准是独立交易原则，也就是假定没有关联关系的两家企业，在类似条件下会怎么定这个价。税务机关看的是这个比较，而不是企业自己觉得合理不合理。
价格依据要看哪些可核验的材料
能支撑价格的材料，通常不是一句“按市场价”，而是能指向具体参照的东西：
- 同期向非关联客户销售同类产品或服务的报价单、合同、发票；
- 公开的行业价格信息、第三方询价记录、比价邮件；
- 成本构成表、成本加成比例的测算过程；
- 定价决策的会议记录或审批记录，注明定价时点和依据。
如果确实找不到可比对象，退一步的做法是把成本、费用、合理利润的测算过程留全，说明这是在没有可比数据情况下的替代方法。缺证据时，风险不是价格高或低，而是被问到时无法说明为什么是这个数。
什么情况下更容易被关注
长期亏损却持续与关联方交易、利润率明显低于同行业、关联交易占收入比重很高、大额资金无偿拆借、境内境外之间转移利润，这几类情形更容易进入关注范围。反过来，业务真实、价格有同期外部参照、资料齐全的交易，即使金额不小，也主要是留存备查的问题。
03税务机关真的会调整吗，调整对象和依据是什么
会，但调整的前提是税务机关认定关联交易不符合独立交易原则，并因此减少企业或其关联方的应纳税收入或所得额。这不是自动发生的，也不是所有关联交易都会被调整。相关规则在《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则的特别纳税调整部分，税务机关需要按法定程序进行。
调整通常涉及的税种是企业所得税，对象是应纳税所得额。调整后可能补税并加收利息，具体处理要按适用的税收法规和当时的有效规定执行。这里不展开具体条款，实际情形以主管税务机关的文书为准。
还有一种容易被混淆的情形：不是特别纳税调整，而是在日常申报或评估中，税务机关认为开票价格明显偏低且无正当理由、或者成本列支与实际不符，直接要求补正申报。这两条路径的依据和处理方式不同，企业遇到时先看清税务机关援引的是哪一类，再决定怎么应对。
04被问到时按这个顺序处理，先自查再提交
收到税务机关的询问、约谈或资料调取要求时，先别急着改账或补合同。第一步是自查交易事实和资料，第二步是按税务机关要求的方式、期限提交，第三步才是根据反馈判断是否需要申请调整或补充说明。
自查要核哪几件事
- 把报告期内的关联交易逐笔列出，包括对方名称、交易内容、金额、开票和收款时间。
- 对每一笔找出定价依据，标出有外部参照的和只有内部测算的。
- 核对合同、订单、发货或服务记录、发票、银行流水在内容、金额、时间上是否一致。
- 整理企业自身的利润率、成本结构，和同期同行业公开数据的差距在哪里。
- 把暂时解释不清的项目单独列出，判断是缺资料还是交易安排本身有问题。
提交材料要注意的边界
提交的是事实材料，不是结论；不清楚的地方如实说明，不要为了凑一个合理的利润率去改账或补签合同。补签、倒签、事后调整凭证，会让原本的定价问题变成凭证真实性问题，处理难度更大。涉及金额较大或跨境安排时，建议在提交前咨询税务师或律师，明确需要提交的范围。
05制度层面还有一层：符合条件的企业要做同期资料
达到规定门槛的关联交易，企业负有准备同期资料（包括主体文档、本地文档和特殊事项文档）的义务，用于说明关联交易是否符合独立交易原则。门槛和文档类型按当时有效的国家税务总局相关规定执行，不同年度可能调整，需要按交易所属期核对原文。
没达到门槛的小微企业，不因此就可以不留资料。日常的合同、发票、比价记录本身就是最基础的支撑，保存期限按《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则和会计档案相关规定执行。不清楚自己是否达到门槛的，可以拨打 12366 纳税缴费服务热线咨询，或向主管税务机关确认。
政策原文可以在国家税务总局网站（https://www.chinatax.gov.cn）和中国政府网政策文件库（https://www.gov.cn/zhengce/）按文件名称检索；法规文本可以在国家法律法规数据库（https://flk.npc.gov.cn）核对有效版本。